Dorobek naukowy Zainteresowania badawcze prof. Elżbiety Niezabitowskiej dotyczą zagadnień architektury i urbanistyki przemysłowej oraz zabytków architektury przemysłowej, a także badań jakościowych w architekturze, zarówno podstawowych jak i stosowanych, w oparciu o metodologię POE – Post-Occupancy Evaluation. Jest autorem około 170 publikacji; w tym w 45 publikacjach jest współautorem. Wśród 21 pozycji w języku angielskim 8 to publikacje zagraniczne, w tym 1 pozycja książkowa autorska z 2018 r. Research Methods and Techniques in Architecture (Routledge, Taylor & Francis Group).
Opracowała około 200 Kart zabytków architektury przemysłowej kopalń: Gottwald, Kleofas, Murcki, Boża Dary (we współpracy z Ewą Szady) oraz samodzielne dla kopalni Juliusz i Bielszowice oraz huty Kościuszko i FlorianArchiwum Wojewódzkiego Urzędu Ochrony Zabytków w Katowicach ul. Francuska 12 Katowice.
Była członkiem rady naukowej i kierownikiem sekcji Architektura nowego angielskojęzycznego czasopisma interdyscyplinarnego ACEE – Architecture, Civil Engineering, Environment wydawanego od 2008 r. w Politechnice Śląskiej w GliwicachArchitecture, Civil Engineering, Environment, Quarterly, ISSN 1899-0142. Była też redaktorką wydziałową serii Architektura w Wydawnictwie Politechniki Śląskiej od 1993 r.