naukowych i w okresie 2005-2016 dyrektorem tego instytutu"50 lat Instytutu Elektroenergetyki Politechniki Warszawskiej – od historii ku przyszłości" Instytut Elektroenergetyki, Politechnika Warszawska, Warszawa,2020, .
Dorobek naukowy Prof. J. Machowski jest współautorem 62 prac badawczych i ekspertyz wykonanych na rzecz energetyki zawodowej, w tym pięciu projektów zagranicznych (Niemcy, Anglia, USA) oraz ponad 50 artykułów w czasopismach międzynarodowych, 9 podręczników i 3 skryptów uczelnianych. Podręcznik "Power System Dynamics. Stability and Control" (którego jest głównym autorem) wydany przez amerykańskie wydawnictwo John Wiley & Sons został uznany przez wydawcę za bestseller i doczekał się trzech wydań.
Prace profesora Jana Machowskiego były cytowane ponad 6345 razy.. Za prace naukowo-badawcze oraz działalność wydawniczą uzyskał kilkakrotnie nagrody ministra oraz odznaczenia i medale zasługi dla energetykiCzasopismo, Elektroenergetyka: współczesność i rozwój. Polskie Sieci Elektroenergetyczne S.A., Nr 3-4 (13-14), 2012: "Kto jest kim w energetyce: Jan Machowski, elektroenergetyka z uczelni i z praktyki" str. 150-153. Był członkiem Komitetu Elektrotechniki PAN (2004-2019) [dostęp 2020-10-13], członkiem Komitetu Wielkich Sieci Elektroenergetycznych CIGRE (1995-2023), Stowarzyszenia IEEE (2005-2025).