Działalność konspiracyjna i służba wojskowa Pogłębiający się kryzys polityczny na archipelagu w ostatniej dekadzie XIX wieku skłonił poetę do zaangażowania się w działalność niepodległościową. W 1894 Palma wstąpił tym samym w szeregi Katipunanu. Było to wzorowane na masonerii tajne stowarzyszenie, które za cel stawiało sobie walkę o niezależność kraju, w owym czasie wciąż będącego kolonialną posiadłością Hiszpanii. Mimo problemów zdrowotnych zaciągnął się do tworzącej się od 1896 filipińskiej armii. Brał w związku z tym udział zarówno w walkach podczas rewolucji filipińskiej, jak i późniejszej wojny amerykańsko-filipińskiej. Służył kolejno w oddziałach dowodzonych przez Rosendo Simona oraz Servillano Aquino.
Aktywność zawodowa oraz działalność literacka Poświęcił się dziennikarstwu oraz aktywności literackiej, stając się szybko jednym z najważniejszych twórców rewolucyjnego okresu filipińskiej historii. Związał się z założonym przez generała Antonio Lunę dziennikiem „La Independencia”. Mimo swojego pisarstwa w języku hiszpańskim został włączony w skład zespołu redakcyjnego tagalskiej sekcji tego pisma. Wraz ze swoim wspomnianym wyżej starszym bratem Rafaelem znalazł się następnie wśród założycieli powstałego w 1901 tygodnika „”.