Bezpośrednio po studiach w 1992 rozpoczęła pracę w Katedrze i Zakładzie Biochemii Farmaceutycznej. Od 2014 w Katedrze i Zakładzie Toksykologii, gdzie rok później awansowała na stanowisko profesor nadzwyczajnej; później została kierowniczką Katedry. W latach 2008–2016 piastowała funkcję prodziekan ds. Oddziału Analityki Medycznej, następnie zaś dziekan. Była pełnomocniczką rektora ds. zarządzania jakością ISO na Wydziale. Prorektor ds. dydaktyki w kadencji 2020–2024.
Zainteresowania naukowe Piwowar obejmują złożone zaburzenia biochemiczne i metaboliczne w patogenezie cukrzycy typu 2 i jej powikłaniach; nowe parametry diagnostyczne (np. cystatyna C) i prognostyczne choroby (np. modyfikowane postaci albuminy, chitotriozydaza), identyfikację substancji naturalnych o właściwościach antyglikooksydacyjnych, analizę wiązania leków do modyfikowanej w warunkach choroby cząsteczki albuminy. Wypromowała czworo doktorów.