FSV Mainz 05 (Niemcy) Slavia Praga (Czechy) 2 – 0 Cork City (Irlandia) Stade Rennais (Francja) 3 – 1 CA Osasuna (Hiszpania) Szachtar Donieck (Ukraina) 4 – 1 Debreceni VSC (Węgry) Tromsø IL (Norwegia) 1 – 0 Galatasaray SK (Turcja) US Palermo (Włochy) 2 – 1 Anorthosis Famagusta (Cypr) Vålerenga Fotball (Norwegia) 0 – 3 Steaua Bukareszt (Rumunia) VfB Stuttgart (Niemcy) 2 – 0 NK Domżale (Słowenia) Viking FK (Norwegia) 1 – 0 Austria Wiedeń (Austria) Vitória SC (Portugalia) 3 – 0 Wisła Kraków (Polska) Vitoria Setubal (Portugalia) 1 – 1 UC Sampdoria (Włochy)
Rewanże:
29 września 2005 AEK Ateny (Grecja) 0 – 1 Zenit St. Petersburg (Rosja) Lewski Sofia (Bułgaria) 1 – 0 AJ Auxerre (Francja) Hertha BSC (Niemcy) 3 – 1 APOEL FC (Cypr) Willem II Tilburg (Holandia) 1 – 3 AS Monaco (Francja) Aris FC (Grecja) 0 – 0 AS Roma (Włochy) SC Heerenveen (Holandia) 5 – 0 Banik Ostrawa (Czechy) CSKA Sofia (Bułgaria) 1 – 0 Bayer 04 Leverkusen (Niemcy) Malmö FF (Szwecja) 1 – 4 Beşiktaş JK (Turcja) Łokomotiw Płowdiw (Bułgaria) 1 – 2 Bolton Wanderers (Anglia) Łokomotiw Moskwa (Rosja) 3 – 2 SK Brann (Norwegia) FC Zürich (Szwajcaria) 2 – 1 Brøndby IF (Dania) SC Braga (Portugalia) 1 – 1 FK Crvena zvezda (Serbia i Czarnogóra) FC Midtjylland (Dania) 1 – 3 CSKA Moskwa (Rosja) Everton F.C.