białka powierzchniowe, pilusy zależne od sortazy, produkcja egzopolisacharydów, systemy R), a także hipotetyczne białka i ruchome elementy genetyczne. Wykazano, że całkowite przewidywane ORF na genom wykazuje szerszy zakres (od 1761 do 2189), co wskazuje, że B. longumum prezentuje wyższy poziom zróżnicowania genetycznego niż inne taksony bifidobakteryjne. Analizowane w tym badaniu genomy B. longum pozwoliły na opisanie jego pangenomu i został on zdefiniowany jako nie w pełni zamknięty, ale zbliżający się do zamkniętego genomu. Geny rdzeniowe są obecne co najmniej raz w każdym badanym genomie, a w tym przypadku stanowią one ~33% wszystkich rodzin genów uzyskanych w analizie. Pozostałe 67% (co w sumie stanowi 2433 rodziny genów) reprezentują geny, które składają się na zmienny lub zbędny genom, który składa się z genów, które są obecne w niektórych, ale nie we wszystkich genomach.
Przypisy
Linki zewnętrzne Roary panX PanOCT OrthoMCL LS-BSR PanPhlAn
Kategoria:Genetyka