Dowodem na to było powierzenie mu w 2017 roku funkcji wicekapitana reprezentacji (kapitanem był wówczas Eben Etzebeth). W czerwcu tego samego roku w meczu z Francją Kolisi zdobył swoje pierwsze przyłożenie na arenie międzynarodowej. Od początku meczu wystąpił także we wszystkich sześciu spotkaniach Rugby Championship 2017 oraz w trzech listopadowych testmeczach.
Po tym, jak w 2018 roku po serii rozczarowujących wyników miejsce Coetzee zajął Rassie Erasmus, Kolisi został mianowany kapitanem reprezentacji. Został wówczas pierwszym czarnoskórym graczem, który dostąpił tego zaszczytu, stając się niejako symbolem zmieniającego się oblicza rugby w Południowej Afryce. Do końca roku rozegrał w kadrze 13 spotkań, wszystkie w pierwszym składzie, jak również wystąpił w barwach Barbarians – Argentyna. Rok później w skróconych z uwagi na puchar świata rozgrywkach Rugby Championship zawodnicy RPA wygrali dwa spotkania (z Australią i Argentyną), remisując mecz z Nową Zelandią, dzięki czemu sięgnęli po końcowe trofeum po raz pierwszy od edycji w 2009 roku. Wkrótce po zakończeniu rozgrywek Kolisi został uwzględniony w składzie na rozpoczynający się we wrześniu 2019 roku puchar świata w Japonii. Mimo porażki w meczu otwarcia z ekipą „All Blacks”, Południowoafrykańczycy awansowali do fazy pucharowej. W ćwierćfinale pokonali drużynę gospodarzy.