W 2007 roku Malacateco wywalczył historyczny awans do gwatemalskiej Liga Nacional, zostając mistrzem drugiej ligi zarówno w jesiennej fazie Apertura, jak i w wiosennej Clausura. Pobyt klubu w pierwszej lidze trwał jednak zaledwie rok (2007–2008), po czym spadł on szczebel niżej. Do Liga Nacional powrócił już w 2010 roku, po zwycięstwie w meczu barażowym z Petapą (1:0). Kilka lat później wywalczył swój pierwszy większy sukces w historii: wicemistrzostwo Gwatemali (Clausura 2019). W sezonie Apertura 2021 pod wodzą szkoleniowca Roberto Hernándeza piłkarze Malacateco zdobyli zaś premierowy tytuł mistrza Gwatemali. Dzięki temu klub wziął udział w pierwszych międzynarodowych rozgrywkach w swojej historii, Lidze CONCACAF, jednak odpadł już w rundzie preliminarnej.
Rozgrywki międzynarodowe Sezon Rozgrywki Runda Klub Dom Wyjazd Ogólnie 2022 Liga CONCACAF QR Sporting San Miguelito 1:1 0:3 1:4
Aktualny skład Stan na 1 października 2023.
Trenerzy
Przypisy
Malacateco