Od 2000 roku właścicielem i prezesem klubu był Milton Mendoza Matta, brat Haroldo Mendozy Matty – lidera Los Mendoza, grupy paramilitarnej i jednego z największych karteli narkotykowych w Ameryce Centralnej, działającego głównie na terenie Petén.
W 2008 roku klub przeniósł swoją siedzibę z Morales do miasteczka San José w departamencie Petén. Inicjatorem projektu był Julián Tesucún, burmistrz San José, utrzymujący kontakty z rodziną Mendoza (według dziennikarzy śledczych z portalu Plaza Pública, Los Mendoza wspierali finansowo kampanię wyborczą Tesucúna). Klub zmienił wówczas nazwę z Deportivo Heredia na Heredia Jaguares de Petén i rozgrywał swoje mecze na nowo powstałym Estadio Julián Tesucún. W 2011 roku Tesucún wygrał wybory do Kongresu Gwatemali i przestał utrzymywać zespół. Drużyna popadła w kłopoty organizacyjne i finansowe – media donosiły, iż klub przestał opłacać niektórym zawodnikom czynsz za mieszkania i musieli oni nocować na stadionie. We wrześniu 2011 drużyna wróciła pod skrzydła rodziny Mendoza i powróciła do Morales.