Był członkiem założycielem Polskiego Stowarzyszenia Biomateriałów, w którym pełnił funkcję Wiceprezesa (1999–2006, 2010–2013), Prezesa (2014–2016), Członka Zarządu (2007–2009, 2017–2020), członkiem prezydium Komitetu Nauki o Materiałach na IV Wydziale - Nauk Technicznych Polskiej Akademii Nauk, członkiem Komitetu Nauki o Materiałach na IV Wydziale Nauk Technicznych PAN i Komisji Nauk Technicznych na III Wydziale Matematycznym, Fizycznym i Chemicznym Polskiej Akademii Umiejętności. Sprawował też funkcję Przewodniczącego organizowanych od 1991 r. w Rytrze corocznych konferencji „Biomaterials in Medicine and Veterinary Medicine”.
Od roku 2007 był Redaktorem Naczelnym czasopisma „Engineering of Biomaterials”. thumb|240px|Grób prof. Jana Chłopka na cmentarzu Batowickim Zmarł 14 listopada 2020 r. w Krakowie, pochowany na cmentarzu Prądnik Czerwony (kwatera CCLXXVII-13-3).
Ordery i odznaczenia
Krzyż Kawalerski Orderu Odrodzenia Polski (2019) Srebrny Krzyż Zasługi (2006)
Źródło:Jan Chłopek na stronie Historia AGH.
Nagrody