Edwards jednak później ucieka i szybko przejmuje majątek korporacyjny partnerów.
Rozgrywka Rozgrywka w Hitman 3 jest podobna do tej z poprzedniej części, będącą przygodową grą akcji opartą na skradaniu. Gracz kontroluje Agenta 47, zabójcę kontraktowego pracującego dla Międzynarodowej Agencji Kontraktowej (ICA), z perspektywy trzeciej osoby, który podróżuje do różnych miejsc na całym świecie, aby wyeliminować zlecane cele. W grze dostępnych jest sześć misji, które osadzone są w Dubaju, Dartmoor w Wielkiej Brytanii, Berlinie, Chongqing, Mendozie w Argentynie oraz w Rumunii. W trakcie misji można zabić swój cel na różne sposoby, jednak najlepiej oceniane są ciche zabójstwa. Za wykonanie zadań gracz otrzymuje punkty doświadczenia. Awansując na wyższy poziom można odblokować takie rzeczy jak nowa broń, nowa pozycja startowa na mapie czy trucizna.
Usługa World of Assasination pozwala na import lokacji i postępu z dwóch poprzednich odsłon. Twórcy umieścili w grze tzw. trwałe skróty, nową funkcję w serii. Każdy etap zawiera pewną liczbę początkowo zamkniętych drzwi, które można otworzyć tylko z jednej strony.