Procedura Podobnie jak w przypadku techniki PCR w pierwszej kolejności przeprowadza się izolację DNA. Kolejnym etapem jest przygotowanie mieszaniny reakcyjnej, której przykład zamieszczony jest w tabeli: +Przykładowy skład mieszaniny reakcyjnej do SRAP-PCROdczynnikiObjętość (µl)Ilość w mieszaninieDNA360 ngH2O2,2 -Master Mix61xStarter F0,44 ngStarter R0,44 ng Po sporządzeniu mieszaniny przeprowadza się w termocyklerze reakcję SRAP-PCR. Przykładową reakcję przedstawia tabela: +Przykładowy profil termiczny reakcji SRAP-PCREtapTemperaturaCzasilość cykliWstępna denaturacja94 °C3 min.1xDenaturacja94 °C1 min.5xAnnealing35 °C1 min.Elongacja72 °C1 min.1xDenaturacja94 °C1 min.36xAnnealing50 °C1 min.Elongacja72 °C1 min.1xKońcowa elongacja72 °C7 min. W celu wizualizacji produktów reakcji i identyfikacji ewentualnych polimorfizmów przeprowadza się elektroforezę.
Zastosowanie SRAP SRAP-PCR jest techniką stosowaną w genetyce roślin uprawnych, do: charakteryzowania plazmy zarodkowej; identyfikacji odmian; mapowania molekularnego; klonowania genów roślin uprawnych;