Na posiedzenia prezydium PRN w Braniewie w dniu 22 sierpnia 1947 podjęto w tym celu specjalną uchwałę o numerze 405, mówiącą o usunięciu inskrypcji w języku niemieckim z kamienia przed szkołą i od tego czasu pozostaje on pustyProtokół nr XXXVI z posiedzenia prezydium PRN w Braniewie z dnia 22 sierpnia 1947, Uchwała nr 405, Protokoły posiedzeń PRN Braniewo, Szukaj w archiwach skan nr 47.
W semestrze zimowym 1942/1943 zawieszone zostały lekcje w starszej klasie dla chłopców ze względu na pobór do wojska, w 1944 również w klasie niższej. Nauka w oddziale żeńskim była prowadzona do 22 stycznia 1945 roku. W tym dniu musiano przerwać lekcje, by udostępnić budynek na tymczasową kwaterę dla żołnierzy i uchodźców cywilnych z całych Prus Wschodnich. Dwa miesiące później, 20 marca, miasto zajęła Armia Czerwona, o dalszej nauce nie mogło być mowy.