Współpraca z organizacjami Naczelna Izba Lekarska (NIL). Samorząd lekarski jest naturalnym partnerem lekarskiego związku zawodowego, funkcjonując w tym samym środowisku, i mając wspólne cele. Współpraca pomiędzy Naczelną Radą Lekarską a Zarządem Krajowym OZZL, oraz pomiędzy poszczególnymi Okręgowymi Radami Lekarskimi a Zarządami Regionów OZZL polega na uzgadnianiu stanowisk w sprawie określonych problemów, udziale we wspólnych organizacjach i doraźnych akcjach. Ruch Obywatelski na rzecz Jednomandatowych Okręgów Wyborczych (JOW). OZZL ściśle współpracował z prekursorem i liderem JOW profesorem Jerzym Przystawą i z Januszem Sanockim. Związek w 2001 przy współpracy z Ruchem JOW zorganizował w Białymstoku w Pałacu Branickich Ogólnopolską Konferencję JOW Poseł z każdego powiatu. Członkowie OZZL brali udział w akcjach informacyjnych i manifestacjach Ruchu pod nazwą Marsz na Warszawę. Centrum im. Adama Smitha (CAS) pierwszy niezależny instytut typu „think tank” w Polsce, promujący idee wolnego rynku. Idee te również promował związek. Owocna okazała się współpraca z ekspertami CAS Krzysztofem Dzierżawskim i Wojciechem Misińskim, zwłaszcza w tworzeniu projektu Racjonalnego systemu opieki zdrowotnej. Europejska Federacja Lekarzy Etatowych (FEMS – European Federation of Salaried Doctors) z biurem w Brukseli.