Wojciech Maciej Karłowski (ur. 10 stycznia 1966) – polski biolog specjalizujący się w biologii molekularnej i bioinformatyce. Profesor nauk biologicznych. Kierownik Zakładu Biologii Obliczeniowej na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu. Jego zainteresowania naukowe obejmują identyfikację niekodujących RNA, genomikę, analizy wysokoprzepustowe i adnotację funkcjonalną sekwencji biologicznych.
Życiorys naukowy Ukończył studia o specjalności biologia molekularna na Wydziale Biologii UAM w 1991 roku. W trakcie studiów odbył trzymiesięczną praktykę w ramach wymiany IAESTE w laboratorium prof. w Instytucie Biochemii Uniwersytetu w Kolonii.
W latach 1991–1996 kształcił się w kierunku genetyki molekularnej roślin w ramach studium doktoranckiego na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. A. Mickiewicza. Jego prace badawcze dotyczyły molekularnych mechanizmów zaangażowanych w procesy symbiotycznego wiązania azotu przez rośliny motylkowe. Rozprawę doktorską pod tytułem 'Geny kodujące brodawkowo-specyficzne białka prolino-bogate w łubinie żółtym’ obronił w 1996 roku. Promotorem w jego przewodzie doktorskim był prof. dr hab. Andrzej Legocki.