Był również członkiem Zarządu Głównego Stowarzyszenia Filmowców Polskich.
Nagrody Silver World Medal na festiwalu Tv & Film Awards 2014 w Nowym Jorku, za film „Campo di Fiori”; Nagroda specjlna Prezesa TVP na Ogólnopolskim Festiwalu Filmów Krótkometrażowych Kraków 2000; Nagroda Wytwórni Filmów Oświatowych i Programów Edukacyjnych w Łodzi za film „To nasza młodość” (2006); Nagroda im. Antoniego Marianowicza za film „Ostatni świadek” na Międzynarodowym Festiwalu Filmowym „Żydowskie Motywy” w 2004 roku; Srebrny Dyplom na międzynarodowym festiwalu filmów dokumentalnych „Człowiek w świecie – o ludzkiej godności, tolerancji i holokauście” w Sztokholmie w 2002 roku, za film „Ostatni świadek”; Nagroda im. Łukasza Hirszowicza w 2002 roku, za film „Ostatni świadek”; W 2006 roku otrzymał List gratulacyjny od Prezydenta RP Lecha Kaczyńskiego honorujący całokształt twórczości.
Życie prywatne Jego żoną była scenarzystka i reżyserka Elżbieta Nekanda-Trepka. Miał córkę Judytę.
thumb|240px|Grób reżysera Michała Nakanda-Trepki na cmentarzu żydowskim przy ul. Okopowej w Warszawie
Michał Nekanda-Trepka zmarł po potrąceniu przez samochód, prowadzony przez pijanego 28-letniego kierowcę, na przejściu dla pieszych na ulicy Świętokrzyskiej w Warszawie. Został pochowany na Cmentarzu Żydowskim przy ul.