Peter Joseph Wagner (ur. 19 sierpnia 1865 w Kürenz, zm. 17 października 1931 we Fryburgu) – niemiecki muzykolog.

Życiorys W latach 1876–1886 uczył się w gimnazjum i przykatedralnej szkole muzycznej w Trewirze, był też chórzystą i organistą tamtejszej katedry. W latach 1886–1890 studiował filologię klasyczną i historię, a następnie muzykologię na Uniwersytecie w Strasburgu, w 1890 roku obronił doktorat na podstawie dysertacji Palestrina als weltlicher Komponist (opublikowana pt. Das Madrigal und Palestrina w „Vierteljahrsschrift für Musikwissenschaft”, VIII, 1892). Od 1890 do 1893 roku był studentem Heinricha Bellermanna i Philippa Spitty na Uniwersytecie Berlińskim, następnie w 1893 roku przeniósł się na Uniwersytet we Fryburgu, gdzie po habilitacji został zatrudniony jako wykładowca muzyki kościelnej i historii muzyki. W latach 1920–1921 pełnił funkcję rektora tegoż uniwersytetu. W latach 1927–1930 był pierwszym przewodniczącym Międzynarodowego Towarzystwa Muzykologicznego.