Średnia liczba dni z opadami śniegu w Małych Karpatach wynosi 25–30, na nizinach 20–25. Liczba dni z pokrywą śniegową wynosi 40–60, od 36 dni w Bratysławie przez 50 dni w Smolenicach po 53 dni w Brezovej pod Bradlom. Na sąsiednich nizinach liczba ta wynosi 30-40 dniDane z 2. poł. XX w., wg: Szomolányi Juraj a kolektív: Malé Karpaty. Tiristický sprievodca ČSSR (...), s. 20-21.
Gleby Gleby są przeważnie brunatne.
Roślinność Małe Karpaty są w większości porośnięte lasami liściastymi – w niższych partiach dębowymi, w wyższych – bukowymi. Na południowych stokach prowadzi się małokarpackie winnice (Rača, Pezinok, Modra) i sady.
Ochrona przyrody Prawie całe pasmo Małych Karpat obejmuje Obszar Chronionego Krajobrazu Małe Karpaty o powierzchni 65 504 ha. Utworzony został w 1976 r. jako pierwsza tego typu jednostka w ówczesnym Kraju Zachodniosłowackim. Później obszar ten został włączony do międzynarodowego programu MaB ("Człowiek i Biosfera"). Szczególnie cenne przyrodniczo tereny objęte są ochroną w kilkunastu rezerwatach przyrody, a kilkadziesiąt innych obiektów (m.in. jaskinie, w tym udostępnioną turystycznie jaskinię Driny) objęto innymi formami ochrony (słow. chránené nálezisko, chránený prírodný výtvor). M. in.