Po dwóch sezonach klub znów zrezygnował z dalszych występów.
Po zakończeniu II wojny światowej, klub wznowił działalność w 1945 roku i z nazwą FC Alzano został zakwalifikowany do Prima Divisione Lombardia. W 1946 klub awansował do Serie C. W 1947 spadł z powrotem do Prima Divisione Lombardia. W 1948 roku w wyniku reorganizacji systemu lig został zdegradowany do Seconda Divisione Bergamo, ale po roku wrócił do Prima Divisione Lombardia. W 1952 po kolejnej reorganizacji systemu lig poziom Prima Divisione Lombardia spadł do szóstego stopnia. W 1959 Prima Categoria Lombardia wróciła na piąty poziom. W 1964 został zdegradowany do Seconda Categoria Lombardia, a w 1965 do Terza Categoria Bergamo. W 1970 awansował do Seconda Categoria Lombardia. W 1973 połączył się z Sporting Club 63 i uzyskał tytuł sportowy, dzięki czemu w sezonie 1973/74 startował w Prima Categoria Lombardia. Przed rozpoczęciem sezonu 1978/79 Serie C została podzielona na dwie dywizje: Serie C1 i Serie C2, wskutek czego klub został zakwalifikowany do Seconda Categoria Lombardia. W 1983 roku klub spadł do Terza Categoria Bergamo. W 1984 otrzymał promocję do Seconda Categoria Lombardia, a w 1985 do Prima Categoria Lombardia. W 1987 na rok znów został zdegradowany do Seconda Categoria Lombardia.