W sezonie 1998/99 w Eccellenza Basilicata startowały dwie miejskie drużyny - stary klub, który przyjął nazwę AC Matera oraz AS Materasassi, który zajął trzecie miejsce i został głównym klubem miasta. W następnym sezonie 1999/2000 zespół AS Materasassi zwyciężył w Eccellenza Basilicata i otrzymał promocję do Serie D. Drugi klub AC Matera zmienił nazwę na AC Matera Promos Consult, zajmując 3.miejsce w Eccellenza Basilicata. Po zakończeniu sezonu 2000/01, w którym zajął 8.miejsce, AC Matera Promos Consult zmienił nazwę na Gaetano Scirea, jednak zrezygnował z dalszych występów i został rozwiązany.
W 2003 klub AS Materasassi zmienił nazwę na FC Matera i kontynuował występy w Serie D. W 2010 liga zmieniła nazwę na Lega Pro Seconda Divisione. W 2011 klub został zdyskwalifikowany z lig zawodowych z powodu zaległości finansowych i rozpoczął występy w najniższej lidze Terza Categoria Materana (D10). Po zakończeniu sezonu 2011/12 klub ogłosił upadłość.