W 1935 roku po wprowadzeniu Serie C Prima Divisione została czwartym poziomem ligowym, a klub otrzymał promocję do Serie C. W 1943 roku na terenie Włoch rozpoczęto działania wojenne II wojny światowej, wskutek czego mistrzostwa 1943/44 zostały odwołane.
Po zakończeniu II wojny światowej, klub wznowił działalność w 1945 roku i został zakwalifikowany do Serie C. W 1948 roku w wyniku reorganizacji systemu lig zespół został zdegradowany do Promozione (D4), ale w 1950 wrócił do Serie C. W 1952 roku w wyniku reorganizacji systemu lig spadł do IV Serie. W 1954 został zdegradowany na rok do Promozione (D5), a potem wrócił do czwartej ligi, która w 1957 zmieniła nazwę na Campionato Interregionale - Seconda Categoria, a w 1959 na Serie D. W 1967 awansował na rok do Serie C, a w 1974 spadł na rok do Promozione Toscana. Przed rozpoczęciem sezonu 1978/79 Serie C została podzielona na dwie dywizje: Serie C1 i Serie C2, wskutek czego Serie D została obniżona do piątego poziomu. W 1979 spadł znów do Promozione Toscana, a w 1981 awansował do Campionato Interregionale. W następnym roku otrzymał promocję do Serie C2. W 1994 roku awansował na rok do Serie C1. W 2000 klub został zdegradowany do Serie D, a w 2001 do Eccellenza Toscana (D6). W 2005 zespół wrócił do Serie D. W 2010 klub został rekonstytuowany pod nazwą US Città di Pontedera SSD.