Biblioteki publiczne w Polsce wkroczyły w trudny okres, w którym władze samorządowe nie zawsze doceniały ich osiągnięcia kulturalne, część z nich uległa likwidacji. Dla Miejskiej Biblioteki Publicznej był to czas wzmożonej aktywności przy dostosowywaniu księgozbioru do potrzeb i gustów mieszkańców Czarnkowa, czego efektem był wzrost zainteresowania czytelnictwem w roku 1991 do poziomu 2 964 osób i 48 171 wypożyczeń. Rok 1996 przyniósł długo oczekiwany sukces w postaci pierwszego miejsca na liście bibliotek województwa pilskiego pod względem ilości zarejestrowanych czytelników. Od 1998 roku animowania działalności kulturalnej w pracy bibliotekarskiej podjęła się Grażyna Fąferek, obecna kierownik biblioteki. 1 lipca 1998 roku Miejska Biblioteka Publiczna weszła w strukturę Miejskiego Centrum Kultury w Czarnkowie.
Struktura W skład Miejskiej Biblioteki Publicznej w Czarnkowie wchodzą:Statut Miejskiego Centrum Kultury w Czarnkowie, 30.01.2014. biblioteka główna z oddziałem dziecięcym: ul.