Wiadomo, że inne epidemie dżumy wystąpiły w latach 1427–28, 1453, 1501, 1519 i 1523. W tym ostatnim przypadku choroba została przywleczona„Przywleczenie choroby” (jak też „zawleczenie choroby” oraz słowa i wyrażenia pochodne) to termin używany przez epidemiologów. przez załogę schwytanego galeonu. Kiedy choroba została odkryta, władze miejskie Mdiny podjęły próbę odizolowania załogi, zatopienia statku i spalenia ładunku. Jego właściciele odmówili, lecz statek został spalony. Mimo to w Birgu wybuchała zaraza; miasto zostało otoczona kordonem i odizolowane od reszty kraju.
Poza dżumą występowały również epidemie innych chorób. Między 1453 a listopadem 1455 epidemia „morbus di la gula et di la punta”, prawdopodobnie szkarlatyny, spowodowała wiele zgonów.
Epidemia w latach 1592–1593
Epidemia ta jest pierwszą udokumentowaną na Malcie. Choroba przybyła statkiem przypływającym z Aleksandrii. Doliczono się około 3300 ofiar, ponad 12% całej populacji archipelagu. Początkowe podjęcie niewłaściwych kroków w związku z chorobą doprowadziło w końcu do wprowadzenia bardziej skutecznych środków – kwarantanny.
Epidemia w 1623