Zmarł 24 grudnia 1898 roku w Łomży. Prawdopodobnie spoczął na tamtejszym cmentarzu, jednak nie zachowała się żadna tablica z inskrypcją, która świadczyłaby o tym. Janusz Gwardiak w „Studiach Łomżyńskich” pisał, iż Zagrzejewski pochowany został prawdopodobnie we wspólnym grobie ze swymi wcześniej zmarłymi kolejnymi dwiema żonami: Maksymilią z Trojanowskich zmarłą 10 XI 1869 r. w wieku 42 lat i Pauliną z Majewskich, zmarłą 9 IV 1890 r. Ich grób zachowany do dziś, usytuowany 15 m na prawo od kaplicy Śmiarowskich nie zachował danych dot. Antoniego ZagrzejewskiegoJ. Gwardiak, Urzędnik - człowiek pióra - prezydent Łomży Antoni Zagrzejewski (1820-1898), "Studia Łomżyńskie", 2001, t. 12, s. 133.. Rodzina Dwukrotnie żonaty. Z pierwszego małżeństwa z Maksymilią z Trojanowskich (zm. w 1869 r.) doczekał ośmiorga dzieci (dwóch córek i sześciu synów). Drugą jego żoną była Paulina z Majewskich - małżeństwo bezdzietneA. Matusiewicz, Zagrzejewski Antoni, [w:] Suwalski słownik biograficzny. T. 1, Suwałki 2021, s.