Ich syn Enrico (Nerik) urodzony w 1885, na krótko przed śmiercią w 1950 został premierem Malty.
Fortunato Mizzi zmarł 18 maja 1905 w Valletcie.
Upamiętnienie W 1922 na fasadzie domu, w którym mieszkał Mizzi, przy 15 Old Mint Street w Valletcie została umieszczona tablica „lapide” z epitafium ku czci Fortunato Mizziego. Tablicę tę odsłonił ówczesny premier Joseph Howard w obecności sir Filippo Sciberrasa, innych członków Zgromadzenia Narodowego i bardzo licznej rzeszy zwolenników. Epitafium w języku włoskim wspominało, że Fortunato Mizzi mieszkał i zmarł w tym domu, i wywyższało jego liczne cnoty i oddanie sprawie narodowej. Na tablicy znajdowała się brązowa podobizna Mizziego o okrągłym kształcie wykonana przez rzeźbiarza Borysa Edwardsa, rosyjskiego emigranta.
Popiersie Fortunato Mizziego, odsłonięte w 1940, można zobaczyć w ogrodach Pincio w Rzymie, obok popiersia Pasquale Paoliego.
8 czerwca 1940 podczas antywłoskiego protestu, wywołanego odsłonięciem dzień wcześniej popiersia Fortunato Mizziego w ogrodach Pincio w Rzymie, zniszczona została tablica w Valletcie.