Jana w ValletcieDekoracja ołtarza została ostatecznie wykonana kilkadziesiąt lat później według nowego projektu najwybitniejszego (i według współczesnych źródeł jedynego) ucznia Cafà .. Pochowany został w kościele San Biagio della Pagnotta przy Via Giulia w Rzymie.
W jego rodzinnym mieście Birgu na Malcie nie ma pomnika ani tablicy ku jego pamięci. Jednak poczta Malty wydała kilka znaczków z rzeźbami Cafà jako motywami.
Dzieła thumb|left|250px|Popiersie papieża Aleksandra VII Niezwykle zajęty przez całe swoje krótkie życie, zdołał sam ukończyć tylko kilka dużych zleceń: Drewniana figura św. Pawła w kolegiacie św. Pawła Rozbitka, Valletta (ok. 1659) Drewniana figura Matki Bożej Różańcowej w kościele Dominikanów, Rabat (Malta) (1660–61) Marmurowy posąg umierającej św. Róży z Limy (podpisany i datowany 1665) w bazylice de Santo Domingo, Lima, Peru. Był w 1668 roku centralnym punktem ceremonii beatyfikacji przyszłej świętej w rzymskiej bazylice Santa Maria sopra Minerva i wysłany do Peru zaraz po tym wydarzeniu. Rzeźba, chociaż ma pewne formalne analogie z dziełem Berniniego Ekstaza świętej Teresy i prawdopodobnie wpłynęła z kolei na Śmierć bł.