31 lipca 2017 przeniósł się do Machidy Zelvia. Zaledwie dzień później został wypożyczony do Kagoshimy United. W Kagoshimie na boisku pojawił się zaledwie raz, 26 sierpnia 2017 w meczu z Kataller Toyama (2:1). 31 grudnia wrócił do Machidy. W niej zadebiutował 4 marca 2018 w meczu z Omiyą Ardija (3:2). Pierwszego gola zdobył 13 dni później, w meczu przeciwko Montedio Yamagata (2:2). W Machidzie rozegrał 56 meczów (55 ligowych), strzelił 4 bramki i dwa razy asystował.
Zimą 2021 wrócił do Europy, dokładniej do bułgarskiego Botewu Wraca. Pierwszy raz w Botewie zagrał 13 lutego 2021 w meczu z Beroe Stara Zagora (1:2). Babunski zaliczył asystę w 19. minucie przy trafieniu Martina Nikołowa. Pierwszego gola strzelił 3 maja 2021 w meczu z SFK Etyr Wielkie Tyrnowo (2:0). Do bramki dołożył także asystę. Łącznie rozegrał 18 spotkań (16 ligowych), strzelił 3 bramki i asystował przy dwóch trafieniach (stan na 21 maja 2021).
Kariera reprezentacyjna Występował w młodzieżowych reprezentacjach Macedonii (U-17, U-19, U-21).
Życie prywatne Jest synem Bobana Babunskiego – piłkarza, a następnie trenera Wardaru Skopje. Jego brat Dawid również jest piłkarzem.