W 1941 Jadwiga i Zygmunt Karłowscy zaangażowali się w działalność konspiracyjną. Podjęli stałą współpracę z organizacją konspiracyjną ziemian „Uprawa”. W 1942 zostali zaprzysiężeni jako żołnierze Armii Krajowej. Oboje, na zlecenie Komendy Okręgu Kraków i podokręgu Rzeszów, organizowali i zaopatrywali punkty sanitarne w terenie. Ich zadaniem było ponadto wyszukiwanie miejsc na konspiracyjne zebrania, szkolenia, noclegi osób z konspiracji i ukrywających się. Od 1943 ich mieszkanie było też kwaterą Stanisława Rostworowskiego.
11 sierpnia 1944 małżeństwo Karłowskich, generał Rostworowski, Stefan Dembiński i służąca Karłowskich, Zofia Ziemba, zostali aresztowani przez gestapo. Zygmunt Karłowski został zamordowany tego samego dnia podczas przesłuchania. Jadwiga Karłowska została umieszczona w KL Płaszów i tam stracona miesiąc później.
W chwili aresztowania przez Niemców Zygmunt i Jadwiga Karłowscy mieli dwoje małych dzieci: Różę (urodzoną w 1941 roku) oraz Elżbietę (1944-1988)
Upamiętnienie W maju 2021 roku imieniem Jadwigi i Zygmunta Karłowskich Rada Miasta Krakowa nazwała skwer u zbiegu ulic św.