Liczba pracowników została znacznie zmniejszona z powojennej liczby ponad 6200 do mniej niż 1500.

W dniu 1 czerwca 1949 roku, kiedy weszła w życie ustawa o urzędzie premiera, Biuro Dworu Cesarskiego stało się Agencją Dworu Cesarskiego (宮内庁 Kunai-chō, Imperial Houshold Agency), zewnętrzną agencją Kancelarii Premiera.

W wyniku reformy rządu centralnego, która weszła w życie 6 stycznia 2001 roku, Agencję Dworu Cesarskiego podporządkowano Urzędowi Gabinetu (内閣府, Naikaku-fu, Cabinet Office).

Struktura Agencja Dworu Cesarskiego, jako organizacja rządowa podległa premierowi, zajmuje się sprawami państwowymi dotyczącymi Domu Cesarskiego. Wśród czynności cesarza w sprawach państwowych określonych w art. 7 Konstytucji Japonii, Agencja pomaga w przyjmowaniu zagranicznych ambasadorów, ministrów, głów państw, przedstawicieli monarchii oraz w pełnieniu funkcji ceremonialnych.

Na czele Agencji stoi Wielki Indendent (jap. 宮内庁長官 Kunaichō-chōkan, ang. Grand Steward), któremu pomaga Zastępca Wielkiego Indendenta (宮内庁次長 Kunaichō-jichō, Vice-Grand Steward).