Drużyny poprzedniej edycji Ekstraklasy 2019 nie przystąpily w sezonie ligowym 2021: BSCC Łódź, Team Słupsk, Tonio Team Sosnowiec. W związku z nieprzystąpieniem BSCC Łódź, Team Słupsk, Tonio Team Sosnowiec do rozgrywek Ekstraklasy 2021 drużyny: Pro-Fart Głowno (9. miejsce), Dragon Bojano (10. miejsce) pozostały w Ekstraklasie 2021. W związku z nieprzystąpieniem FC Toruń (2. miejsce w I lidze) do rozgrywek Ekstraklasy 2021, Zdrowie Garwolin (3. miejsce w I lidze) uzyskało awans do Ekstraklasy. Pro-Fart Głowno zmienił nazwę zespołu na Pro-Fart Jeżów.
Rozgrywki Ekstraklasa
Terminarz I turniej
II turniej
Tabela Tabela po II turniejach Ekstraklasy: Miejsce Drużyna Mecze Punkty Zwyc. Zw.pd. Zw. pk. Por. Bramki +/- 1. KP Łódź924800144:18+26 2. Boca Gdańsk917510336:27+9 3. Hemako Sztutowo916501333:29+4 4. Futsal & Beach Soccer Kolbudy915500444:41+3 5. FC10 Zgierz913401437:29+8 6. UKS Milenium Gliwice912311332:33-1 7. Zdrowie Garwolin912400545:450 8. Dragon Bojano99300641:47-6 9. Rapid Lublin97201630:300 10. Pro-Fart Jeżów90000915:58-43
Legenda do tabeli: Zwyc. – zwycięstwa Zw. pd. – zwycięstwa po dogrywce (za dwa punkty) Zw. pk. – zwycięstwa po rzutach karnych (za jeden punkt) Por.