Jest Członkiem Związku Kompozytorów Polskich, przypisanym do Oddziału w Krakowie. Był jurorem w ok. 20 konkursach kompozytorskich w Polsce i we Włoszech. Głównym wydawcą utworów Wojciecha Widłaka jest Polskie Wydawnictwo Muzyczne. W latach 1991-1996 był członkiem Chóru Cantores Cracovienses działającego przy bazylice NSPJ Ojców Jezuitów w Krakowie pod opieką duszpasterską ks. prof. dra hab. Stanisława Ziemiańskiego SJ.
Działalność akademicka Wykłada w Akademii Muzycznej im. Krzysztofa Pendereckiego w Krakowie od 1995 – najpierw jako asystent w Katedrze Organów (1995-1996), a następnie w Katedrze Kompozycji, przechodząc kolejne szczeble awansu akademickiego od asystenta po profesora tytularnego. W 1999 uzyskał kwalifikacje I stopnia (artystyczny odpowiednik doktoratu), 2004 – stopień doktora habilitowanego, 2012 – tytuł profesora. Prowadzi klasę kompozycji, w której studiuje młodzież z Polski i wielu innych krajów. Do grona jego uczniów i absolwentów należą m.in.: Nadim Husni, Peter Javorka, Viacheslav Kyrylov, Paweł Malinowski, R. Yigit Özatalay, Michal Pal’ko, Marcin Pączkowski, Jarosław Płonka, Paweł Siek, Katarzyna Szwed. Jest promotorem doktoratów w dziedzinie sztuk muzycznych (klawesynistka Goska Isphording, kompozytorzy: Henryk J. Botor, Jarosław Płonka, Michał Gronowicz, Issidoros Papadakis, Josuè W.