W zakresie uzbrojenia przeciwlotniczego „Yura” był wielokrotnie przezbrajany. W momencie wejścia do służby składało ono się z dwóch pojedynczych armat przeciwlotniczych kal. 76,2 mm (8 cm), zamontowanych po bokach pierwszego komina. Zapas amunicji dla każdej z armat wynosił 240 sztuk, była ona rozdzielnego ładowania. Uzbrojenie to uzupełniały dwa karabiny maszynowe Typu 3 kalibru 6,5 mm. Karabiny te umiejscowiono pomiędzy drugim a trzecim kominem. Na przełomie 1933/1934 roku na okręcie zamontowano stanowisko poczwórnych wkm Hotchkiss kalibru 13,2 mm na platformie przed nadbudówką dziobową. Dwie armaty plot. kal. 76,2 mm zastąpiono w tym samym czasie dwoma podwójnymi stanowiskami karabinów maszynowych Typu 93 kal. 13,2 mm, które z kolei zastąpiono w 1938 roku podwójnymi stanowiskami dział Typu 96 kal. 25 mm. Karabiny kal. 6,5 mm zostały zastąpione na przełomie 1933/1934 roku przez dwa karabiny maszynowe Lewis kal. 7,7 mm. W odróżnieniu od innych jednostek, okręt nie miał wymienionego siódmego działa kal. 140 mm na uniwersalne kal. 127 mm.
Okręt miał także cztery podwójne wyrzutnie torped kalibru 610 mm, do których używano torped Typu 8. „Yura” miała także zainstalowane tory minowe dla 48 min morskich.