Kariera Współpraca z Jamesem Brownem (1965-1970) W 1965 roku obecny w Macon James Brown dostrzegł grającego Stubblefielda i poprosił go o spotkanie, co zaowocowało przyjęciem go do jego zespołu. Przez kolejne sześć lat, zespół miał dwóch perkusistów – Clyde'a Stubblefielda oraz Johna „Jabo” Starksa. Obaj perkusiści na przestrzeni kilku lat grając w zespole Browna, dali podwaliny pod nowoczesne funkowe brzmienia perkusyjne.
Clyde Stubblefield stworzył perkusję pod wiele klasycznych utworów Jamesa Browna, w tym „Cold Sweat”, „There Was a Time”, „I Got the Feelin”, „Say It Loud – I'm Black and I'm Proud”, „Ain't It Funky Now”, „Mother Popcorn”, „Give It Up or Turnit a Loose” czy „Get Up, Get into It, Get Involved”.
Jego solówka perkusyjna w utworze „Funky Drummer” jest jednym z najczęściej wykorzystywanych sampli w historii muzyki, głównie w muzyce hip-hop. Można ją usłyszeć w utworach takich wykonawców jak Public Enemy, Run-DMC, N.W.A, LL Cool J, Beastie Boys, Dr. Dre, Jay-Z, oraz w innych gatunkach, w utworach m.in. George'a Michaela czy Eda Sheerana.