Emmanuel Karagiannis (ur. 22 listopada 1966 w Maasmechelen) – belgijski piłkarz greckiego pochodzenia piłkarz grający na pozycji defensywnego pomocnika. Był reprezentantem Belgii.
Kariera klubowa Swoją karierę piłkarską Karagiannis rozpoczął w klubie Patro Eisden, w którym w sezonie 1983/1984 zadebiutował w drugiej lidze belgijskiej. Grał w nim do 1986 roku i wtedy też przeszedł do pierwszoligowego KSV Waregem. W zespole Waregem występował przez sześć sezonów i w 1992 roku odszedł z niego do drugoligowego RFC Seraing. W sezonie 1992/1993 wywalczył z nim awans do pierwszej ligi. W Seraing grał jeszcze przez kolejne dwa sezony.
Latem 1995 Karagiannis przeszedł do Anderlechtu. 4 sierpnia 1995 zadebiutował w nim w przegranym 1:3 wyjazdowym meczu z Eendrachtem Aalst. W sezonie 1995/1996 wywalczył z Anderlechtem wicemistrzostwo Belgii.
W 1996 roku Karagiannis odszedł z Anderlechtu do Royalu Antwerp FC. Swój debiut w nim zaliczył 10 sierpnia 1996 w zwycięskim 3:2 domowym meczu z KV Mechelen. W Royalu występował przez rok.
Latem 1997 Karagiannis został zawodnikiem Germinalu Ekeren, który dwa lata później został przemianowany na Germinal Beerschot. Swój debiut w Germinalu zanotował 9 sierpnia 1997 w zwycięskim 3:1 domowym meczu z RWD Molenbeek.