Current Sociology. 54 (1): 112–132. Dostęp 11-09-2016.. Po upadku kalifatu Fatymidów w 1171, z nastaniem dynastii Ajjubidów, uczelnia została oddana sunnitom, którzy zmienili jej profil nauczania na tożsamy. Saladyn rozkazał zniszczyć bezpowrotnie ponad sto tysięcy książek, manuskryptów i prac zgromadzonych w czterdziestu pokojachMadeleine Pelner Cosman, Linda Gale Jones (1 stycznia 2009). Handbook to Life in the Medieval World, 3-Volume Set, Volumes 1-3. Infobase Publishing. s. 148. . Dostęp 11-09-2016.. W XIX wieku ściśle teologiczny program nauczania uczelni został zliberalizowany pod wpływem nacisków ze strony takich reformatorów jak Dżamal ad-Din al-Afghani i Muhammad Abduh. Po rewolucji w 1952 roku, w 1961 doszło do oddzielenia medresy przy meczecie, oficjalnie podnosząc ją do rangi państwowego uniwersytetuNasser Rabbat. Al-Azhar Mosque: An Architectural Chronicle of Cairo's History, w The Encyclopaedia of Islam, Part 157. Brill. s. 63. . Dostęp 10-09-2016.Carol Summerfield, Mary Devine, Anthony Levi (1998). International Dictionary of University Histories. Taylor & Francis. s. 13. . Dostęp 10-09-2016..