Publikacje Autor książki o funkcjonowaniu współczesnych linii lotniczych Leci z nami pilot, wydanej przez Gruner+Jahr Polska w 2011 (). W 2017 roku napisał wstęp do polskiej edycji książki dziennikarza CNN Richarda Questa pod tytułem Zaginiony lot MH370, poświęconej zniknięciu samolotu malezyjskich linii lotniczych.
Kontrowersje Metody i efekty zarządzania Sebastiana Mikosza budzą wiele kontrowersji. Część ekspertów uważa, że skutecznie zrestrukturyzował PLL LOT, inni – że pomogły mu pieniądze z rządu, podobnie podzielone są zdania w przypadku oceny efektów zarządzania Kenya Airways, gdzie Mikosz polegał na wsparciu ze strony rządu. Zarządzając Pocztą Polską także domagał się zwiększenia rządowego wsparcia, pomimo przyznania Poczcie gigantycznej rekompensaty za nierentowną usługę pocztową i braku przedstawienie strategii rozwoju nierentownego giganta. Pieniądze z rekompensat przeznaczył na program dobrowolnych odejść oferując pracownikom 12-miesięczne odprawy, zamiast na inwestycje.