Obecnie (2022) takie narzędzia jak: żelazne żegadła (kautery) i kulociągi ze zbiorów Rafała Czerwiakowskiego znajdują się wśród eksponatów w Muzeum Historii Medycyny Uniwersytetu Jagiellońskiego Collegium Medicum, które od 1992 roku ma swoją siedzibę w Domu Towarzystwa Lekarskiego Krakowskiego przy ulicy Radziwiłłowskiej 4.
Był mężem Marii z Maszyńskich, mieli syna Ignacego Rafała Napoleona (1808-1882).
Pochowany na cmentarzu Rakowickim w Krakowie, (pas 25, wsch., gr. rodz.). Był jedną z pierwszych znanych i zasłużonych postaci, które zostały pochowane na nowym cmentarzu. Pierwszy nekrolog informujący o pochówku na cmentarzu Rakowickim w „Gazecie Krakowskiej”, który ukazał się w 1816 roku dotyczył właśnie pogrzebu profesora Rafała Czerwiakowskiego.
Dzieła Autor szeregu prac, między innymi: Wywód o narzędziach cyrulickich (1779) Dyssertacyja o szlachtności, potrzebie i użytku chirurgii (1791) Narząd opatrzenia chirurgicznego (w sześciu częściach, ukazała się po śmierci profesora, 1816-17) Chirurgia praktyczna (pozostała w rękopisie, wydana drukiem w 1969).