Na jednostce ulokowano ponadto:
Kadrę Marynarki Wojennej i Kancelarię Ewidencji Floty. Szkołę Podchorążych Marynarki Wojennej. Centrum Wyszkolenia Specjalistów Floty. Biuro Historyczne i Biuro Hydrograficzne. Załogi szkolnych okrętów ORP "Wilia" i "Iskra", ewakuowane z Casablanki.
Podczas służby jednostka przyjmowała znaczących gości – pokład ORP „Gdynia” odwiedzili m.in. Winston Churchill (wtedy Pierwszy Lord Admiralicji), król Jerzy VI, księżna Kentu, a także naczelny wódz gen. Władysław Sikorski oraz prezydent RP Władysław Raczkiewicz.
Dalsze losy Służba jako okręt-baza zakończyła się 30 czerwca 1941 roku. Statek został oddany polskiej marynarce handlowej, powracając do swojej dawnej nazwy – SS „Kościuszko”. Do końca działań zbrojnych był intensywnie wykorzystywany jako transportowiec wojska na wodach Atlantyku, Morza Śródziemnego oraz Oceanu Indyjskiego.
W 1946 roku, po zakończeniu wojny, weteran został ostatecznie sprzedany Brytyjczykom. Otrzymał nową nazwę – „Empire Helford” – i był używany głównie do transportowania powracających do ojczyzny brytyjskich żołnierzy.