W Mauthausen kierował masowymi egzekucjami więźniów przez rozstrzelanie i powieszenie. Skazywał również więźniów na okrutne kary i osobiście znęcał się nad nimi. Brał także udział w morderstwach dokonywanych w komorach gazowych Mauthausen. Aresztowany przez aliantów 23 grudnia 1945, zasiadł na ławie oskarżonych w procesie załogi Mauthausen-Gusen (US vs. Johann Altfuldisch i inni) przed amerykańskim Trybunałem Wojskowym w Dachau jako jeden z głównych oskarżonych. 13 maja 1946 Zoller skazany został na karę śmierci. Wyrok wykonano przez powieszenie w więzieniu Landsberg koło Monachium.
Bibliografia Dobosiewicz Stanisław, Mauthausen-Gusen. Samoobrona i konspiracja, Warszawa 1980, s. 353. Lasik Aleksander, Organizational Structure of Auschwitz Concentration Camp, [w:] Auschwitz 1940–1945. Central Issues in the History of the Camp, vol,. I: The Establishment and Organization of the Camp, Oświęcim 2000, s. 162. Maršálek Hans, Die Geschichte des Konzentrationslager Mauthausen. Dokumentation, Wiedeń 1974, s. 162. Rabitsch Gisela, Das KL Mauthausen, [w:] „Schriftenreihe der Vierteljahrshefte für Zeitgeschichte”, Nr. 21: Studien zur Geschichte der Konzentrationslager, Stuttgart 1970, s. 54. Dokumenty z procesu US vs.