16 stycznia 1919 powstał bezpartyjny rząd Ignacego Paderewskiego, w skład którego weszli przedstawiciele ZLN: Władysław Seyda (minister dzielnicy „pruskiej”), Józef Englich (minister skarbu), ks. Antoni Stychel (wicemarszałek Sejmu). Kiedy wiosną 1920 na wschodzie sytuacja na froncie stała się krytyczna, ZLN zaatakował Piłsudskiego, stając się jednym z inspiratorów powstania Rady Obrony Państwa, w skład której z ramienia endecji wszedł Roman Dmowski.
W tym czasie program ZLN można zamknąć w kilku punktach: nacjonalizm, jedność narodu, likwidacja podziałów klasowych, głównym zagrożeniem dla państwa polskiego są Niemcy, postulowanie umiarkowanej ekspansji na wschód, gospodarka o kształcie prywatno-kapitalistycznym, sprzeciw wobec państwowego interwencjonizmu, poparcie dla ubezpieczeń robotniczych i reformy rolnej, ale sprzeciw wobec przymusowej parcelacji ziem, kultywowanie polskiej tradycji, ducha religijnego i narodowego, szczególna pozycja w państwie Kościoła katolickiego, wzmocnienie władzy parlamentu, a osłabienie prezydenta.