W tym samym czasie nauczał entomologii na Harvardzie, dawał wykłady w muzeum oraz uczęszczał na zajęcia do Lawrence Scientific School, gdzie studiował z wieloma sławnymi harvardzkimi naukowcami, w tym Asą Grayem, Jeffriesem Wymanem i Nathanielem Shalerem.
W 1867 roku wrócił do Baltimore na posadę asystenta bibliotekarza Peabody Institute. W 1870 roku awansował tam na kierownika biblioteki. Posadę tę zachował do końca życia. Brał aktywny udział w tworzeniu się w Baltimore nowej uczelni wyższej, Uniwersytetu Johnsa Hopkinsa. W 1876 roku został jego pierwszym profesorem nadzwyczajnym. W latach 1880–1911 był rektorem.
Ostatnia jego publikacja, Recognition of two North American species of Cicada, ukazała się w 1905 roku. Dalszą pracę naukową uniemożliwiło mu pogorszenie wzroku związane z jaskrą. Zmarł w 1913 roku w rodzinnym mieście.