Charakterystyka Jeziora związane są z wielkim lodowcem Inylczek. Tworzą się w dolnym biegu lodowca Północny Inylczek. Dolne jezioro powstaje na wysokości ok. 3300 m n.p.m., natomiast Górne ok. 100 m wyżej. Woda gromadzi się w części doliny zagrodzonej jęzorem lodowcowym lodowca Południowy Inylczek. Lodowa „tama” zapobiega odpływowi z jeziora przez większą część roku, jednak kiedy w końcu, na skutek utrzymującej się odpowiednio długo dodatnich temperatur, w „tamie” wytopi się dziura, jezioro spływa z reguły w ciągu trzech dni. Kiedy to następuje, wielkość wypływu z jeziora może wynosić do 1000 m³ wody na sekundę, co powoduje poważne powodzie, zwykle ze zniszczeniami infrastruktury w dole rzeki na terytorium Kirgistanu, a często zagraża również elementom zagospodarowania w rzece Aksu na terytorium ChinBormudoi A., Shabunin A., Hazarika M., Zaginaev V., Samarakoon L.: Studying the outburst of the Merzbacher lake of Inylchek glacier, Kyrgyzstan with Remote Sensing and field data.