W 1790 ożenił się z Anną, córką Jana Laglera, burgrabiego z Rožmitála, która urodziła mu trzynaścioro dzieci, siedmioro z nich przeżyło. Z powodu różnych poglądów na kwestię edukacji dzieci popadł w konflikt z miejscowym proboszczem Kašparem Zacharem, a jego prośby o fundusze na remont i pracę w szkole były często odrzucane.
Jakub Ryba pracował nie tylko jako nauczyciel, ale również był dyrygentem chóru i organistą w kościele parafialnym Podwyższenia Krzyża Świętego w Starym Rožmitálu, a także w kaplicy filialnej św. Jana Nepomucena przy szkole na rynku w Rožmitálu. Oryginalne organy w kaplicy w 1905 zastąpiono nowymi, ale w kościele stoi do dziś instrument, który w 1750 kupił na własny koszt proboszcz Antonín Platnýř.
Wiele swoich kompozycji Ryba napisał na potrzeby lokalnego chóru. Niektóre ułożył dla bardziej zaawansowanych chórów, zwłaszcza chóru pilskiego. Na potrzeby lokalnej parafii uczył śpiewu, gry na organach, fortepianie, skrzypcach, altówce, wiolonczeli, flecie, klarnecie i waltorni.