Concerto pour le Violoncello (N 542) z 1800 i o rok młodszy koncert skrzypcowy Un grand concert pour le Violon principal d-moll (N 543) należą do najwybitniejszych i dzieł kompozytora.
Na pograniczu kompozycji świeckich i sakralnych sytuują się utwory organowe Ryby. Jedynym zachowanym cyklem tych kompozycji jest zbiór Novae et liberae cogitationes per Toccatas, Phantasias, Fugas et Preludios expressa, organoque accomodata 1798 (N 486-490), który Ryba zadedykował swojemu bratu Wacławowi. Ten niedokończony zbiór utworów organowych świadczy o mistrzowskim opanowaniu organów przez Rybę, ale także o jego postępowych aspiracjach muzycznych.
Twórczość religijna Wśród licznych dzieł religijnych Ryby szczególne znaczenie mają jego pieśni religijne, pastorałki i msze. Warto wymienić jednogłosowe pieśni maryjne Svatohorský kůr (N 9-16), do których zachował się akompaniament orkiestrowy, podobnie jak do Oktáv neb osmidenní pobožnost k sv. Janu Nepomuckému (Oktawy pieśni świętojańskich lub ośmiodniowego nabożeństwa do św. Jana Nepomucena) z lat 1803–1804 (N 1-9). W zachowanych Pohřebních písní (Pieśniach żałobnych) z 1804–1805 (N 17-31) zauważyć można charakter świecki utworów.