Podstawowymi przedmiotami w pierwszym okresie działania szkoły były: greka, łacina, włoski i francuski. Uczono innych przedmiotów, zwanych „innymi naukami”. Uczniowie uczyli się w czterech budynkach na terenie miasta Janina.
Szkoła w czasach administracji Anastasiosa Sakellariosa, 1833-1862 mały|Szkoła Zosimaia - widok od frontu, 2019 r. W 1833 r. Anastasios Sakellarios z Zagori, były uczeń Athanasiosa Psalidasa – wybitnego intelektualisty greckiego oświecenia i doradcy Ali Paszy – został dyrektorem Zosimai. W 1840 r. do programu edukacyjnego szkoły dodano jeszcze trzy klasy.
Wraz z administracją Sakellariosa Zosimaia stała się jedną z najważniejszych szkół greckojęzycznych w świecie osmańskim. Większość studentów pochodziła z Epiru, ale było też wielu ze społeczności greckich w całym Imperium Osmańskim, m.in. z Rumelii Wschodniej. Zdarzały się również transfery uczniów z innych znaczących szkół, takich jak Greckie Prawosławne Liceum Phanar (gr. Μεγάλη του Γένους Σχολή), zwanym Wielką Szkołą Narodu w ówczesnym Konstantynopolu. Ponadto wielu Turków i Albańczyków również uczęszczało do Zosimaia: po ukończeniu nauki, niektórzy stali się ważnymi osobistościami w swoich krajach.