Następnym portem macierzystym „Kommuny” był Leningrad, gdzie w czasie niemieckiego oblężenia podczas II wojny światowej okręt podniósł m.in. 6 okrętów podwodnych, a także cztery ciężkie czołgi KW, dwa traktory i 31 samochodów, które zatonęły w jeziorze Ładoga. Załoga statku została odznaczona medalami „Za obronę Leningradu”. 25 kwietnia 1942 okręt został uszkodzony przez ciężką artylerię.
Po II wojnie światowej zdecydowano pozostawić okręt w służbie, zlecając jego remont stoczni zagranicznej. Od 29 maja 1950 do 15 lipca 1951 „Kommuna” była remontowana i zmodernizowana w stoczni De Schelde w Holandii. 29 listopada 1956 podniesiono z głębokości 45 m radziecki okręt podwodny M-200 „Miest′” (XV serii), który zatonął po zderzeniu z niszczycielem „Statnyj” 21 listopada 1956. W listopadzie 1957 roku wydobyto z głębokości 73 m okręt podwodny M-256 (projektu A615), który zatonął 26 września 1957 r. w Zatoce Tallińskiej i na którym zginęło 35 marynarzy.