Po II wojnie światowej Łankiejmy znalazły się w granicach Polski, a niemieccy mieszkańcy ewakuowali się lub zostali przymusowo wysiedleni do Niemiec. Po roku 1946 władze komunistyczne zezwoliły Kościołowi rzymskokatolickiemu na użytkowanie obiektu sakralnego w Łankiejmach. 12 stycznia 1946 ks. Stanisław Lachowicz, dziekan reszelski urzędujący w Korszach dokonał poświęcenia kościoła w Łankiejmach i wprowadził porządek nabożeństw. W latach 1946–1962 placówka duszpasterska w Łankiejmach stanowiła ekspozyturę parafii w Korszach. 24 lutego 1962 r. biskup Tomasz Wilczyński erygował parafię pw. św. Jana Chrzciciela w ŁankiejmachRafał Kociński, op.cit., s. 19–20..
Łankiejmski kościół, podobnie jak wiele innych obiektów sakralnych na Ziemiach Zachodnich i Północnych, został przekazany przez państwo polskie na własność Kościołowi katolickiemu z mocy prawa 29 czerwca 1971 r.Ustawa z dnia 23 czerwca 1971 r. o przejściu na osoby prawne Kościoła Rzymskokatolickiego oraz innych kościołów i związków wyznaniowych własności niektórych nieruchomości położonych na Ziemiach Zachodnich i Północnych ().