Dalsze losy thumb|Zniszczona elewacja budynku około 1945 roku thumb|Budynek w panoramie Antwerpii od strony Skaldy w 2012 roku; w środkowej części zdjęcia widoczna katedra Najświętszej Marii Panny W czasie II wojny światowej Boerentoren dwukrotnie uległ uszkodzeniu: po raz pierwszy w dniach 5–7 września 1944 roku, kiedy to trafiło w niego około 50 niemieckich pocisków artyleryjskich, po raz drugi zaś 6 stycznia 1945 roku, w wyniku uderzenia niemieckiego samolotu-pocisku V-1. Kolejnych zniszczeń budynek doznał podczas pożaru z 25 lutego 1954 roku. Spowodował on całkowite spalenie kondygnacji od 21 do 24 oraz uszkodzenie niedawno zamontowanego nadajnika telewizyjnego.
W połowie lat 60. XX wieku cały gmach postanowiono przekształcić w biurowiec stanowiący główną siedzibę banku KBC z zachowaniem kilku sklepów na parterze. Z tego względu do 1968 roku przeprowadzono renowację budynku pod kierownictwem architektów Léona Stynena i Paula De Meyera.