Łącznie wystąpił w 46 meczach Ligue 1, po czym przeniósł się do Paris Saint-Germain. W rozgrywkach 2004/2005 na boisku pojawił się osiemnaście razy, jednak w kolejnym sezonie rozegrał już 28 spotkań. Stworzył wówczas linię pomocy razem z Vikashem Dhorasoo, Modeste M’Bamim oraz Bonaventure Kalou. PSG zajęło dziewiąte miejsce w lidze, ale dzięki zwycięstwu w Pucharze Francji zakwalifikowało się do eliminacji Pucharu UEFA. Francuski zespół w 1/8 finału tych rozgrywek został jednak wyeliminowany przez Benfikę Lizbona. Paris Saint-Germain zmagania Ligue 1 zakończyło dopiero na piętnastym miejscu mając tylko dziewięć punktów przewagi nad strefą spadkową. Jérôme rozegrał 27 meczów, w których strzelił dwie bramki.

1 września 2009 roku, w ostatnim dniu letniego okienka transferowego Rothen trafił do zespołu aktualnego mistrza Szkocji – Rangers F.C. na zasadzie wypożyczenia. Umowa z klubem z Ibrox Park będzie obowiązywać przez rok. Zadebiutował 12 września podczas meczu z Motherwell. Do 2010 rozegrał w Rangers jeszcze trzy mecze. Następnie trafił do Ankaragücü.