por. także: Mateusz Gniazdowski, wpis na platformie X z 16 października 2020 r., https://x.com/M_Gniazdowski/status/1317211742443810817. Był też współkoordynatorem polskiej części sieci środkowoeuropejskiego konsorcjum think-tanków Think Visegrad. W latach 2013–2022 był przewodniczącym Rady Programowej Forum Polsko-Czeskiego przy Ministrze Spraw Zagranicznych. Po objęciu stanowiska Ambasadora RP został członkiem ex officio Rady Programowej Forum Czesko-Polskiego przy czeskim MSZ.
Praca naukowa W swojej działalności naukowej zajmuje się głównie historią stosunków polsko-czeskich i polsko-słowackich w XX w. Jest współautorem lub redaktorem kilkunastu publikacji książkowych i autorem kilkudziesięciu artykułów naukowych. Podczas pracy w PISM zajmował się m.in. problematyką strat wojennych i reparacji. W 2008 r. opublikował odnalezioną w Archiwum Akt Nowych dyrektywę Jakuba Bermana dla Biura Odszkodowań Wojennych, dotyczącą ustalenia liczby polskich ofiar II wojny światowejM. Gniazdowski, „Ustalić liczbę zabitych na 6 milionów ludzi”. Dyrektywy Jakuba Bermana dla Biura Odszkodowań Wojennych przy Prezydium Rady Ministrów, "Polski Przegląd Dyplomatyczny" 2008, nr 1(41), s. 99–113..